Симптомы очень простые - логотипы добавляются, а документы (картинки, документы - любые файлы) нельзя добавить к статье/разделу в админке SPIP.
Причина - пустая таблица в базе данных spip_types_documents.
В этой таблице хранятся описание основных типов файлов.
Устранение проблемы - скопировать содержимое таблицы из "нормального" сайта в поврежденный при помощи phpmyadmin или mysqladminer. Образец SQL файла для SPIP 2.1.14 можно скачать также тут.